Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Prr33-202ENSMUST00000151580 399 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm18776-201ENSMUST00000188833 654 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm15409-201ENSMUST00000135240 520 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NischQ80TM9 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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