Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm29083-201ENSMUST00000189205 733 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 CT573086.4-201ENSMUST00000226729 342 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Topbp1Q6ZQF0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms