Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Dpyd-201ENSMUST00000039177 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtifQ6PEE2 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
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