Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Usp49Q6P9L4 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usp49Q6P9L4 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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