Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 E330011O21Rik-205ENSMUST00000211317 1062 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
BC061212Q6P8K3 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
BC061212Q6P8K3 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms