Protein–RNA interactions for Protein: Q6KAU4

Mvb12b, Multivesicular body subunit 12B, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mvb12bQ6KAU4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Mvb12bQ6KAU4 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Mvb12bQ6KAU4 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms