Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
CltbQ6IRU5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms