Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX4

Krt39, Keratin, type I cytoskeletal 39, mousemouse

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt39Q6IFX4 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 F730043M19Rik-204ENSMUST00000148740 3312 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm42599-201ENSMUST00000201308 469 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Krt39Q6IFX4 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Krt39Q6IFX4 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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