Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm29560-201ENSMUST00000191526 881 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc18Q640L5 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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Ccdc18Q640L5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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