Protein–RNA interactions for Protein: Q62361

Trh, Pro-thyrotropin-releasing hormone, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrhQ62361 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
TrhQ62361 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
TrhQ62361 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms