Protein–RNA interactions for Protein: Q62147

Sspn, Sarcospan, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SspnQ62147 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
SspnQ62147 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
SspnQ62147 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
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