Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Phox2aQ62066 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Phox2aQ62066 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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