Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Itga6Q61739 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms