Protein–RNA interactions for Protein: Q61473

Sox17, Transcription factor SOX-17, mousemouse

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Length 419 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox17Q61473 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Sox17Q61473 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Lbh-201ENSMUST00000024857 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox17Q61473 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox17Q61473 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox17Q61473 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox17Q61473 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Sox17Q61473 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Kif5a-201ENSMUST00000099172 6295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Rmi1-201ENSMUST00000042450 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sox17Q61473 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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