Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Anp32e-204ENSMUST00000168106 2890 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm7537-201ENSMUST00000221660 1414 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Nsf-202ENSMUST00000103075 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm45657-201ENSMUST00000211318 1349 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Ggt1-208ENSMUST00000134503 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Mre11Q61216 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms