Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Nmt2-202ENSMUST00000091504 1676 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Klf3Q60980 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.6 ms