Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Abcc10-201ENSMUST00000047970 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Rbbp4Q60972 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms