Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cnot7Q60809 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms