Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm13255-201ENSMUST00000117255 547 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Olfr362-201ENSMUST00000100144 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cacna1c-225ENSMUST00000219223 7483 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
PtprnQ60673 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms