Protein–RNA interactions for Protein: Q5XG71

Utp20, Small subunit processome component 20 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,788 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp20Q5XG71 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Csmd2os-202ENSMUST00000179945 643 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Utp20Q5XG71 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm13286-201ENSMUST00000117750 537 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tcf25-210ENSMUST00000212880 827 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Utp20Q5XG71 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms