Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 L3mbtl2-208ENSMUST00000174229 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bhlha9Q5RJB0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms