Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Lrrc47Q505F5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Lrrc47Q505F5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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