Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm6630-201ENSMUST00000119199 454 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Txnrd2-205ENSMUST00000126778 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm20414-201ENSMUST00000172918 646 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Shank3Q4ACU6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm21759-201ENSMUST00000178345 1828 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm36235-201ENSMUST00000223158 1694 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Shank3Q4ACU6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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