Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0Q1

Dnah12, Dynein heavy chain 12, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 3,086 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah12Q3V0Q1 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Atp6v1g2-202ENSMUST00000118384 483 ntTSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm4924-205ENSMUST00000211099 490 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm9661-201ENSMUST00000221611 1122 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Dnah12Q3V0Q1 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm9916-201ENSMUST00000192943 1228 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Llph-201ENSMUST00000020444 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Dnah12Q3V0Q1 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms