Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Rxra-206ENSMUST00000166775 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Med12l-206ENSMUST00000199659 11006 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.55□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Apol7a-203ENSMUST00000175919 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 1810041L15Rik-201ENSMUST00000080751 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ubr1-201ENSMUST00000028728 7768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Galnt15-201ENSMUST00000022460 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tnc-204ENSMUST00000107377 7100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Dll4-201ENSMUST00000102517 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ctnnd1-205ENSMUST00000111670 5047 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC8.54□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r26-205ENSMUST00000189694 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.53□□□□□ -1.04
D130052B06RikQ3UW13 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms