Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Usp19Q3UJD6 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm36635-201ENSMUST00000221152 1332 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Celf2-205ENSMUST00000114927 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp19Q3UJD6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms