Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHC0

Tnrc6c, Trinucleotide repeat-containing gene 6C protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6cQ3UHC0 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Kdm6bos-201ENSMUST00000129924 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tspo2-201ENSMUST00000024794 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ccndbp1-208ENSMUST00000171260 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mapk1ip1-201ENSMUST00000075667 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26632-201ENSMUST00000181120 1400 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11957-201ENSMUST00000118304 779 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm12246-201ENSMUST00000129126 503 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Prop1-201ENSMUST00000051159 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnrc6cQ3UHC0 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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