Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Puf60Q3UEB3 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms