Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Trafd1Q3UDK1 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms