Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
LbrQ3U9G9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms