Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rabif-201ENSMUST00000047978 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Ulk3Q3U3Q1 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Ulk3Q3U3Q1 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms