Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm3159-203ENSMUST00000177764 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm3269-202ENSMUST00000178137 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm3594-203ENSMUST00000179747 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 AC118750.1-201ENSMUST00000214163 675 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Cd3e-201ENSMUST00000102832 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Rnf40Q3U319 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf40Q3U319 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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