Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Trappc9Q3U0M1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Trappc9Q3U0M1 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms