Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf3c3Q3TMP1 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Slc10a7-202ENSMUST00000209490 3485 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf3c3Q3TMP1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms