Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Trpc7-207ENSMUST00000173817 2406 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm28510-201ENSMUST00000190572 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm23200-201ENSMUST00000104379 132 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Treml4Q3LRV9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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