Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ptcd3Q14C51 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Gm14208-201ENSMUST00000119645 678 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ptcd3Q14C51 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms