Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Atp2b3Q0VF55 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Atp2b3Q0VF55 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms