Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5X1

Lrriq1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrriq1Q0P5X1 Gm21454-202ENSMUST00000192204 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm21440-201ENSMUST00000192749 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20831-202ENSMUST00000194411 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm20807-201ENSMUST00000194687 1336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm21425-202ENSMUST00000195626 1345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ldb3-203ENSMUST00000022330 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tipin-205ENSMUST00000216594 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm14165-201ENSMUST00000121456 952 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm32872-201ENSMUST00000220037 205 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-225ENSMUST00000179658 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Hax1-201ENSMUST00000079724 1139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ctxn2-201ENSMUST00000099452 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm22937-201ENSMUST00000103954 131 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm26626-201ENSMUST00000180989 713 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr335-ps-201ENSMUST00000223545 939 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Haao-201ENSMUST00000000687 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Gm17606-201ENSMUST00000169818 234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1335-202ENSMUST00000219094 1148 ntAPPRIS P2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 AC164556.1-201ENSMUST00000221318 751 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Prl7b1-201ENSMUST00000080595 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1335-201ENSMUST00000084313 1148 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 P2rx1-202ENSMUST00000092938 1119 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Lrriq1Q0P5X1 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms