Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Znf541Q0GGX2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms