Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tmem14a-202ENSMUST00000027065 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tgm3Q08189 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms