Protein–RNA interactions for Protein: Q07643

Col9a2, Collagen alpha-2(IX) chain, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a2Q07643 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Arhgap1-204ENSMUST00000111331 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm16564-201ENSMUST00000162545 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col9a2Q07643 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms