Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Il6st-201ENSMUST00000070731 5207 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dixdc1-203ENSMUST00000117646 5719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cdx4Q07424 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms