Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm12798-201ENSMUST00000124786 666 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Prrx2Q06348 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms