Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cab39Q06138 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms