Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Arhgap10-202ENSMUST00000210519 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Tff2Q03404 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms