Protein–RNA interactions for Protein: Q02650

Pax5, Paired box protein Pax-5, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax5Q02650 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Trim25-203ENSMUST00000107896 5590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rpl18a-201ENSMUST00000054220 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Pax5Q02650 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms