Protein–RNA interactions for Protein: Q02085

Snai1, Zinc finger protein SNAI1, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai1Q02085 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snai1Q02085 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snai1Q02085 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ntpcr-202ENSMUST00000065135 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snai1Q02085 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Dnajb6-212ENSMUST00000198694 505 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snai1Q02085 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms