Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Apol7e-201ENSMUST00000096358 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Saa3-201ENSMUST00000006956 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Ascl1Q02067 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms