Protein–RNA interactions for Protein: Q01065

Pde1b, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1bQ01065 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Kank4-201ENSMUST00000102790 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Pde1bQ01065 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Pde1bQ01065 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms