Protein–RNA interactions for Protein: P97801

Smn1, Survival motor neuron protein, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smn1P97801 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Smn1P97801 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 BC052040-203ENSMUST00000166472 2770 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Npbwr1-201ENSMUST00000044180 3692 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Magee1-201ENSMUST00000033578 3550 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smn1P97801 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.8 ms